Ourense, 1940. Cada vez que Elena (Maribel Verdú) cierra la puerta de casa, echa la llave de sus secretos. Su marido, Ricardo (Javier Cámara), amenazado por una despiadada persecución ideológica, lleva años escondido en el piso donde conviven con sus hijos, Elenita (Irene Escolar) y Lorenzo (Roger Princep).

Salvador (Raúl Arevalo), un diácono desorientado tras la experiencia de luchar en el frente, llega al seminario de Ourense.

Alertado por las dudas en la vocación del joven, el Rector (José Ángel Egido) le destina a dar clase en el colegio donde estudia Lorenzo. Creyendo viuda a Elena, Salvador se obsesiona con ella hasta poner en peligro la frágil realidad de la familia.

Heridos y zarandeados por las circunstancias, los protagonistas de Los girasoles ciegos se golpean contra un muro de represión, amores imposibles y derrotas emocionales, tras un rayo de luz que les devuelva a la vida.

José Luis Cuerda vuelve sobre la victoria moral de los vencidos; sobre la memoria histórica, que nunca dejará de ser lo que fue, aunque no se hable de ella, y vuelve sobre Galicia. Los girasoles ciegos camina por la derrota moral de los vencidos, los de la Guerra Civil española, a través de cuatro historias de horror y desolación, cuatro relatos para avivar la memoria contra el olvido de los perdedores. Acaba de terminar la contienda y son años de represión y dolor, de miedos, de valores pervertidos.

Fueron los amigos de Cuerda quienes primero vieron la empatía que podría existir entre el cineasta y la obra de Alberto Méndez. "Tienes que hacer una adaptación", le decían unos. "¿Por qué no llevas al cine Los girasoles ciegos?", le decían otros. Él había leído la obra del que fuera su amigo en los años de decadencia de la dictadura franquista en Televisión Española.

Entre el elenco actoral, actores de reconocido prestigio como Maribel Verdú, que rueda junto a Cuerda por primera vez, Javier Cámara (Fuera de carta, Hable con ella) y Roger Príncep (El orfanato).